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판례 / 2차납세의무자지정및납세고지처분취소
판례 정보 광주고등법원제주재판부 세무

2차납세의무자지정및납세고지처분취소

원고는 피고가 2023. 7. 31. 원고에게 한 주식회사 △△△에 대한 제2차 납세의무자 지정 및 749,391,070원의 납부고지처분 취소를 구하였다. 제1심은 제2차 납세의무자 지정처분 취소 청구 부분을 각하하고 납부고지처분 취소 청구를 기각하였으며, 원고는 청구 기각 부분에 대해서만 항소하였다. 항소심은 2019사업연도 법인세에 대한 제2차 납세의무 성립 여부는 사업연도 말일인 2019. 12. 31.을 기준으로 판단해야 하는데, 당시 원고가 회생절차 중이어서 체납법인에 대한 경영상 영향력을 행사할 수 없었던 것으로 보인다고 판단하였다. 이에 따라 원고가 국세기본법 제39조 제2호의 과점주주에 해당한다고 인정할 증거가 부족하다고 보아 납부고지처분을 취소하였다.

2024누1698 선고 2025.01.22 판결 마지막 업데이트 2026.05.29

기본 정보

법원
광주고등법원제주재판부
사건번호
2024누1698
사건구분
누
선고일
2025.01.22
상단 광고
상단 광고
목차 사실관계 판단 결과 핵심 쟁점 판례 포인트 자주 묻는 질문 판결 내용 관련 법령 관련 판례

사실관계

정리된 사실관계가 없습니다.

판단 결과

선고

핵심 쟁점

  • 법인세에 대한 과점주주의 제2차 납세의무 성립 여부를 어느 시점을 기준으로 판단할 것인지
  • 원고가 체납법인의 지분 100%를 보유한 사실만으로 국세기본법 제39조 제2호의 과점주주에 해당한다고 볼 수 있는지
  • 회생절차 중인 주주가 보유주식에 기하여 체납법인의 경영에 지배적인 영향력을 행사하였다고 인정할 수 있는지
  • 법인세 경정·고지일과 법인세 납세의무 성립일을 구별하여야 하는지
  • 제2차 납세의무자 지정처분 취소 청구 부분의 소가 적법한지

판례 포인트

  • 과점주주의 제2차 납세의무는 주주 유한책임 원칙의 중대한 예외이므로 적용 요건을 엄격하게 해석하여야 한다.
  • 법인세에 대한 제2차 납세의무 성립 여부는 특별한 사정이 없는 이상 해당 법인세 사업연도의 종료일을 기준으로 판단한다.
  • 법인세 경정·고지일은 납세의무 확정일일 수 있으나, 제2차 납세의무 판단 기준이 되는 납세의무 성립일과는 구별된다.
  • 주식 100% 보유 사실만으로 곧바로 국세기본법 제39조 제2호의 과점주주 요건 중 경영에 대한 지배적 영향력 행사가 인정되는 것은 아니다.
  • 주주가 회생절차 중이어서 관리인이 법원의 허가를 받아 주주권을 행사한 사정은 경영에 대한 지배적 영향력 행사 여부 판단에서 중요하게 고려될 수 있다.
  • 제출된 증거만으로 과점주주 해당성을 인정할 수 없으면 그 전제에서 이루어진 납부고지처분은 위법하여 취소된다.

자주 묻는 질문

Q 회생절차 중인 100% 주주도 체납법인의 법인세에 대해 제2차 납세의무를 질 수 있나요?

A 광주고등법원 제주재판부는 원고가 체납법인의 지분 100%를 보유했다는 사정만으로 제2차 납세의무를 인정할 수 없다고 보았습니다. 원고는 2019사업연도 말일인 2019. 12. 31. 당시 회생절차 중이었고, 보유주식에 기해 체납법인의 경영에 지배적인 영향력을 행사할 수 없었던 것으로 판단되었습니다.

Q 과점주주의 제2차 납세의무는 어느 시점을 기준으로 판단하나요?

A 이 판결은 법인세에 대한 과점주주의 제2차 납세의무 성립 여부는 특별한 사정이 없는 한 해당 법인세의 사업연도 종료일을 기준으로 보아야 한다고 판단했습니다. 피고가 법인세를 경정·고지한 2023. 4. 3.은 납세의무의 확정일일 뿐, 성립일과는 다르다고 보았습니다.

Q 국세기본법상 과점주주로 보려면 주식 보유 외에 무엇이 필요한가요?

A 판결은 국세기본법 제39조 제2호에 따라 주식 또는 출자지분이 50%를 초과하는 것뿐 아니라 법인의 경영에 대해 지배적인 영향력을 행사해야 한다고 설명했습니다. 제2차 납세의무는 주주 유한책임 원칙에 대한 중대한 예외이므로 적용 요건을 엄격하게 해석해야 한다고 보았습니다.

Q 광주고등법원 제주재판부는 749,391,070원의 납부고지처분을 왜 취소했나요?

A 법원은 원고가 2019. 12. 31. 당시 체납법인의 지분 100%를 보유한 사실은 인정했습니다. 그러나 원고가 회생절차 중이어서 체납법인에 대한 경영상 지배적 영향력을 행사했다고 보기 어렵고, 피고가 제출한 증거만으로 과점주주성을 인정할 수 없다고 보아 749,391,070원의 납부고지처분을 취소했습니다.

Q 2차 납세의무자 지정처분취소 청구와 납부고지처분취소 청구의 결론은 어떻게 달랐나요?

A 이 사건에서 2차 납세의무자 지정처분취소 청구 부분은 부적법하다고 보아 각하되었습니다. 반면 원고가 항소한 납부고지처분취소 청구 부분은 이유 있다고 보아 제1심판결을 취소하고 납부고지처분을 취소했습니다.

판결 내용

2차납세의무자지정및납세고지처분취소

[광주고등법원(제주) 2025. 1. 22. 선고 2024누1698 판결]

【전문】

【원고, 항소인】

주식회사 ○○○ (소송대리인 법무법인 뿌리깊은나무 담당변호사 김영삼)

【피고, 피항소인】

제주세무서장

【제1심판결】

제주지방법원 2024. 9. 10. 선고 2024구합5210 판결

【변론종결】

2024. 12. 4.

【주 문】

1. 제1심판결 중 납부고지처분취소 청구 부분을 취소한다.
2. 피고가 2023. 7. 31. 원고에게 한 주식회사 △△△에 대한 749,391,070원의 납부고지처분을 취소한다.
3. 소송 총비용 중 1/5은 원고가, 나머지는 피고가 각 부담한다.

【청구취지 및 항소취지】

1. 청구취지
피고가 2023. 7. 31. 원고에게 한 주식회사 △△△에 대한 2차 납세의무자 지정 및 749,391,070원의 납부고지처분을 취소한다.
2. 항소취지
주문과 같다(제1심은 원고의 2차 납세의무자 지정처분의 취소 청구 부분에 관한 소를 각하하고, 납부고지처분의 취소 청구를 기각하였는데, 원고는 그중 청구 기각 부분에 대해서만 항소하였다).

【이 유】

1. 제1심판결의 인용
이 법원이 이 사건에 관하여 적을 이유는 아래와 같이 고쳐 쓰는 외에는 제1심판결의 이유와 같으므로, 행정소송법 제8조 제2항, 민사소송법 제420조 본문에 의하여 이를 그대로 인용한다.
○ 제1심판결 4쪽 16행의 "결정결정"을 "경정결정"으로 고쳐 쓴다.
○ 제1심판결 4쪽 19행부터 7쪽 21행까지를 아래와 같이 고쳐 쓴다.
"⑴ 국세기본법 제39조 제2호는 법인의 재산으로 그 법인에 부과되거나 그 법인이 납부할 국세 및 강제징수비에 충당하여도 부족한 경우, 그 국세의 납세의무 성립일 현재 소유주식이 해당 법인의 발행 주식 총수 또는 출자총액의 100분의 50을 초과하면서 그 법인의 경영에 대하여 지배적인 영향력을 행사하는 주주(이하 ‘과점주주’라 한다)에게 그 부족한 금액에 대한 제2차 납세의무를 지도록 규정하고 있다.
위 규정의 취지는 회사의 경영을 사실상 지배하는 실질적인 운영자인 과점주주는 회사의 수익은 자신에게 귀속시키고 그 손실은 회사에 떠넘김으로써 회사의 법인격을 악용하여 이를 형해화시킬 우려가 크므로 이를 방지하여 실질적인 조세평등을 이루려는 데 있다(헌법재판소 1997. 6. 26. 선고 93헌바49 등 전원재판부 결정 참조).
이와 같은 과점주주의 제2차 납세의무는 사법상 주주 유한책임의 원칙에 대한 중대한 예외로서 본래의 납세의무자가 아닌 제3자에게 보충적인 납세의무를 부과하는 것이기 때문에 그 적용 요건을 엄격하게 해석하여야 한다(대법원 2019. 5. 16. 선고 2018두36110 판결 등 참조).
한편, 국세기본법 제21조 제1항은 "국세를 납부할 의무는 이 법 및 세법에서 정하는 과세요건이 충족되면 성립한다."라고 규정하고 있고, 같은 조 제2항 제1호 본문은 법인세의 경우 과세기간이 끝나는 때, 즉 법인의 각 사업연도 종료일(법인세법 제4조 제1항 제1호 참조)을 그 국세를 납부할 의무의 성립시기로 규정하고 있다. 그러므로 법인의 주주에게 법인세에 대한 과점주주로서의 제2차 납세의무가 성립하는지 여부는 특별한 사정이 없는 이상 당해 법인세에 대한 사업연도의 종료일을 기준으로 판정하여야 한다.
⑵ 원고가 체납법인의 지분 100%를 보유하고 있는 사실은 앞서 본 바와 같다. 그러나 이를 비롯한 앞서 본 처분의 경위 등 인정사실에 앞서 든 증거 및 변론 전체의 취지에 의하여 인정되는 다음과 같은 사정, 즉 ① 이 사건 납부고지처분은 체납법인의 ‘2019사업연도 법인세’에 대한 제2차 납세의무에 따른 것인 점, ② 위 법인세 납세의무의 성립일인 체납법인의 2019사업연도 말일은 2019. 12. 31.이므로, 원고에게 실제로 위 체납 법인세에 대한 제2차 납세의무가 성립하는지 여부는 이때를 기준으로 판정하여야 하는 점(피고의 2019사업연도 법인세 경정·고지일인 2023. 4. 3.은 국세기본법 제22조 제2항 단서에 따른 법인세 납세의무의 확정일로서 그 성립일과 다르다), ③ 그런데 원고는 2019. 12. 31. 당시 서울회생법원의 2019. 3. 18. 자 2019회합100028호 회생개시결정으로 인한 회생절차에 있었고, 그로 인해 체납법인에 대하여 그 보유주식에 기하여 경영상의 영향력을 행사할 수 없었던 것으로 보이는 점(갑 제4호증의 기재에 의하더라도 원고가 아닌 그 관리인이 법원의 허가를 받아 체납법인의 임시 주주총회를 소집하고 그 주주총회에서 의결권을 행사하였음이 확인된다 ) 등을 앞서 본 법리에 비추어 보면, 원고가 체납법인의 지분 100%를 보유하고 있었다는 사실 및 피고가 제출하는 증거만으로는 원고가 체납법인의 2019사업연도 법인세에 대하여 제2차 납세의무를 지는 ‘과점주주’에 해당한다고 인정할 수 없고, 달리 이를 인정할 만한 증거가 없다.
⑶ 결국 원고가 체납법인의 2019사업연도 법인세에 대하여 국세기본법 제39조 제2호에 따른 제2차 납세의무를 진다고 할 수 없으므로, 피고가 이와 다른 전제에서 원고에게 한 이 사건 납부고지처분은 위법하여 취소되어야 한다."
○ 제1심판결 9쪽 아래에서 2행 다음에 아래의 내용을 추가한다.
"제4조(과세소득의 범위)
① 내국법인에 법인세가 과세되는 소득은 다음 각 호의 소득으로 한다. 다만, 비영리내국법인의 경우에는 제1호와 제3호의 소득으로 한정한다.
1. 각 사업연도의 소득
2. 청산소득(淸算所得)
3. 제552조의2에 따른 토지등 양도소득"
2. 결론
이 사건 소 중 2차 납세의무자 지정처분취소 청구 부분은 부적법하여 이를 각하하고, 원고의 이 사건 납부고지처분취소 청구는 이유 있어 이를 인용하여야 한다. 제1심판결 중 이 사건 납부고지처분취소 청구 부분은 이와 결론을 달리하여 부당하므로, 원고의 항소를 받아들여 이를 취소하고, 이 사건 납부고지처분을 취소한다.

판사 이재신(재판장) 송주희 강민수

관련 법령

행정소송법 제8조 제2항 민사소송법 제420조 국세기본법 제39조 제2호 헌법재판소 1997. 6. 26. 선고 93헌바49 등 전원재판부 결정 대법원 2019. 5. 16. 선고 2018두36110 판결 국세기본법 제21조 제1항 국세기본법 제21조 제2항 제1호 법인세법 제4조 제1항 제1호 국세기본법 제22조 제2항 법인세법 제4조 법인세법 제552조의2 서울회생법원 2019. 3. 18.자 2019회합100028호 회생개시결정 제주지방법원 2024. 9. 10. 선고 2024구합5210 판결

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