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판례 / 공익사업 시행으로 받은 상가 보수비의 사업소득 여부
판례 정보 서울행정법원 일반행정

공익사업 시행으로 받은 상가 보수비의 사업소득 여부

원고는 2002년부터 이 사건 건물에서 부동산임대업을 영위하던 중, 도시계획시설사업으로 건물 일부가 수용되어 건물 편입 부분 보상비, 잔여 부분 보수비, 보수공사 기간 중 일실 임대수입액을 지급받았다. 원고는 잔여 부분 보수비 중 상가 부분에 해당하는 금액을 수입금액으로 신고하지 않았고, 피고는 이를 사업소득 총수입금액에 산입하여 종합소득세를 경정·고지하였다. 법원은 이 사건 보상금이 수용으로 인한 사업 관련 손실 등을 보상하기 위해 지급된 금액으로서 소득세법 시행령상 사업과 관련된 수입금액에 해당한다고 보아 원고의 청구를 기각하였다.

서울행정법원-2024-구합-85960 2025.11.14 마지막 업데이트 2026.05.25

기본 정보

법원
서울행정법원
사건번호
서울행정법원-2024-구합-85960
사건구분
구합
선고일
2025.11.14
상단 광고
상단 광고
목차 사실관계 판단 결과 핵심 쟁점 판례 포인트 자주 묻는 질문 판결 내용 관련 법령 관련 판례

사실관계

정리된 사실관계가 없습니다.

판단 결과

정리된 판단 결과가 없습니다.

핵심 쟁점

  • 공익사업 수용으로 지급받은 잔여 건축물 보수비가 부동산임대업의 사업소득 총수입금액에 산입되는지 여부
  • 이 사건 보상금이 양도소득 대상 대가보상금인지, 사업 관련 손실보상금인지 여부
  • 보상금을 실제 보수비로 지출하였는지 여부가 수입금액 산입 판단에 영향을 미치는지 여부

판례 포인트

  • 사업자가 사업장을 수용 또는 양도하면서 지급받은 보상금 중 자산 대가보상금이 아닌 사업 관련 손실보상금은 사업소득으로 총수입금액에 산입될 수 있다.
  • 잔여 건축물 보수비 명목으로 지급된 금액이라도 사업과 관련하여 감소되는 소득이나 발생하는 손실을 보상하기 위한 금액이면 사업 관련 수입금액에 해당한다.
  • 보상금을 실제 보수비로 지출한 경우에는 필요경비 인정 여부가 문제될 수 있으나, 그 사정은 보상금 자체를 수입금액에 산입하는 판단과는 별개의 문제로 보았다.
  • 수용 이후 건물을 철거하고 새 건물을 건설하였는지 여부도 이 사건 보상금의 수입금액 산입 여부와 특별한 관련이 없다고 판단하였다.
  • 법원은 피고의 종합소득세 경정·고지 처분이 적법하다고 보아 원고의 청구를 기각하였다.

자주 묻는 질문

Q 공익사업 수용으로 받은 상가 잔여 건물 보수비도 부동산임대업의 사업소득 수입금액에 포함되나요?

A 서울행정법원은 원고가 부동산임대업을 하던 건물 일부가 공익사업으로 수용되면서 받은 잔여 부분 보수비 중 상가 부분 상당액을 사업소득의 총수입금액에 산입할 수 있다고 보았습니다. 이 보상금은 수용으로 인해 임대사업과 관련해 발생한 손실 등을 보상하기 위해 지급된 것으로, 소득세법 시행령상 사업과 관련된 수입금액에 해당한다고 판단했습니다.

Q 사업장이 수용되어 받은 보상금은 언제 양도소득이 아니라 사업소득으로 보나요?

A 법원은 사업자가 사업을 하다가 사업장이 수용되거나 양도되어 받은 보상금 중 자산 자체의 대가보상금은 양도소득으로 볼 수 있다고 전제했습니다. 그러나 영업보상, 휴·폐업보상, 이전보상, 그 밖에 사업과 관련해 감소한 소득이나 발생한 손실을 보상하는 금액은 해당 사업의 사업소득으로 보아 총수입금액에 산입하는 것이 타당하다고 보았습니다.

Q 잔여 건축물 보수비 보상금을 실제로 보수공사에 썼다면 수입금액에서 제외되나요?

A 법원은 보상금을 실제 보수비로 지출했는지 여부는 그 보상금을 수입금액에 산입하는 문제와 특별한 관련이 없다고 보았습니다. 다만 원고가 보상금을 보수비로 지출한 경우에는 해당 금액을 필요경비로 인정받을 여지가 있을 뿐이라고 판단했습니다.

Q 수용 이후 건물을 철거하고 새 건물을 지었는지가 보수비 보상금 과세에 영향을 주나요?

A 이 판결은 원고가 수용 이후 건물을 철거하고 새로운 건물을 건설했는지 여부가 보상금을 수입금액에 산입하는 것과 특별한 관련이 없다고 보았습니다. 보상금의 성격이 수용으로 인한 사업 관련 손실을 보상하는 금액인지가 핵심 판단 기준이었습니다.

Q 2024구합85960 사건에서 원고의 종합소득세 부과처분 취소 청구는 받아들여졌나요?

A 서울행정법원은 2025년 11월 14일 원고의 청구를 기각했습니다. 피고가 2023년 10월 31일 원고에게 한 2021년도 귀속 종합소득세 46,742,000원 부과처분에 대해, 법원은 이 사건 보상금을 사업소득 총수입금액에 산입할 수 있다고 보았습니다.

Q 이 사건에서 상가 보수비 보상금 중 얼마가 종합소득세 수입금액으로 산입되었나요?

A 원고는 잔여 건물 보수비로 257,890,000원을 지급받았고, 이를 2021년도 종합소득세 신고 때 수입금액으로 신고하지 않았습니다. 세무서장은 그중 상가 부분에 상응하는 60%인 154,734,000원을 수입금액에 산입해야 한다고 보아 종합소득세를 경정·고지했습니다.

Q 잔여 건축물 보수비는 어떤 성격의 보상으로 보았나요?

A 법원은 토지보상법과 그 시행규칙을 근거로, 건축물 일부가 취득되거나 사용되어 잔여 건축물에 보수가 필요한 경우 그 유용성을 종래 목적대로 유지하는 데 통상 필요한 공사비가 보수비로 평가된다고 설명했습니다. 이 사건 보상금은 수용으로 인한 임대사업 관련 손실 등을 보상하기 위해 지급된 금액으로 보았습니다.

판결 내용

  • 종소
공익사업 시행으로 받은 상가 보수비의 사업소득 여부 국승
  • 서울행정법원-2024-구합-85960
  • 귀속년도 : 2021
  • 심급 : 1심
  • 등록일자 : 2025.12.29.
  • 생산일자 : 2025.11.14.
  • 진행상태 : 완료
관련 법령
소득세법 시행령 제51조 제3항
요지 판결내용 상세내용

요지

소득세법상 사업과 관련된 수입금액은 사업자에게 귀속되었거나 귀속될 금액이므로 이 사건 보수비는 이 사건 수용으로 인한 이 사건 사업과 관련한 손실 등을 보상하기 위하여 지급된 것으로서 수입금액에 해당함

판결내용

1. 원고의 청구를 기각한다.
2. 소송비용은 원고가 부담한다.

상세내용

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사 건 2024구합85960 종합소득세부과처분취소

원 고 P◎H

피 고 AA세무서장

변 론 종 결 2025. 9. 26.

판 결 선 고 2025. 11. 14.

주 문

1. 원고의 청구를 기각한다.

2. 소송비용은 원고가 부담한다.

청 구 취 지

피고가 2023. 10. 31. 원고에 대하여 2021년도 귀속 종합소득세 46,742,000원(가산세 포함)의 부과처분을 취소한다.

이 유

1. 처분의 경위

 가. 원고는 2002. 7. 1.부터 BB CC구 DD동 소재 지상 건물(이하 ‘이 사건 건물’이라 한다)을 통해 부동산임대업(이하 ‘이 사건 사업’이라 한다)을 영위하였다.

 나. BB시 CC구청장이 시행한 도시계획시설사업(이하 ‘이 사건 공익사업’이라한다)으로 이 사건 건물 중 일부가 수용(이하 ‘이 사건 수용’이라 한다)됨에 따라 원고는 2021. 12. 28. 건물 편입(수용) 부분 보상비 88,560,600원, 건물 미편입 잔여 부분 보수비 257,890,000원, 잔여 건축물에 대한 보수공사 기간 중 일실 임대수입액(4개월분) 22,320,000원을 지급받았다.

 다. 원고는 2021년도 귀속 종합소득세를 신고·납부하면서 위 257,890,000원은 수입금액으로 신고하지 않았다. 피고는 위 257,890,000원 중 이 사건 건물의 상가 부분에 상응하는 60%에 해당하는 154,734,000원(이하 ‘이 사건 보상금’이라 한다)이 원고의 2021년도 귀속 종합소득세에 관한 수입금액에 산입되어야 한다는 전제에서 2023. 10. 31. 원고에 대하여 2021년도 귀속 종합소득세 46,742,000원(가산세 포함)을 경정·고지

하였다(이하 ‘이 사건 처분’이라 한다).

【인정근거】다툼 없는 사실, 갑 제2 내지 4호증, 을 제3, 4호증의 각 기재, 변론 전체의 취지

2. 이 사건 처분의 위법 여부

 가. 관련 법리

 사업자가 사업을 영위하다가 그 사업장이 수용 또는 양도됨으로 인하여 그와 관련하여 사업시행자로부터 지급받는 보상금은, 그 내용이 양도소득세 과세대상이 되는 자산 등에 대한 대가보상금인 경우는 양도소득으로, 그 이외의 자산의 손실에 대한 보상이나 영업보상, 휴ㆍ폐업보상, 이전보상 등 당해 사업과 관련하여 감소되는 소득이나 발생하는 손실 등을 보상하기 위하여 지급되는 손실보상금인 경우는 그 사업의 태양에 따른 사업소득으로 보아 그 총수입금액에 산입함이 상당하다(대법원 2008. 1. 31. 선고 2006두9535 판결 등 참조).

 나. 판단

 1) 공익사업을 위한 토지 등의 취득 및 보상에 관한 법률(이하 ‘토지보상법’이라 한다) 제75조의2 제1항 본문은 ‘사업시행자는 동일한 소유자에게 속하는 일단의 건축물의 일부가 취득되거나 사용됨으로 인하여 잔여 건축물의 가격이 감소하거나 그 밖의 손실이 있을 때에는 국토교통부령으로 정하는 바에 따라 그 손실을 보상하여야 한다’ 고 규정하고, 토지보상법 시행규칙 제35조 제2항은 ‘동일한 건축물소유자에 속하는 일단의 건축물의 일부가 취득 또는 사용됨으로 인하여 잔여 건축물에 보수가 필요한 경우의 보수비는 건축물의 잔여부분을 종래의 목적대로 사용할 수 있도록 그 유용성을 동일하게 유지하는데 통상 필요하다고 볼 수 있는 공사에 사용되는 비용(「건축법」 등 관계법령에 의하여 요구되는 시설의 개선에 필요한 비용은 포함하지 아니한다)으로 평가한다’고 규정하고 있다.

 이 사건 보상금은 이 사건 수용으로 인한 이 사건 사업과 관련한 손실 등을 보상하기 위한 목적으로 위와 같은 법령에 따라 지급된 것인데, 앞서 본 법리에 비추어 보면, 이는 소득세법 시행령 제51조 제3항 제5호가 규정하는 ‘사업과 관련된 수입금액으로 해당 사업자에게 귀속되었거나 귀속될 금액’에 해당한다. 그러므로 이 사건 보상금은 이 사건 사업에 따른 사업소득으로 총수입금액에 산입하여야 한다.

 2) 이에 대하여 원고는 이 사건 보상금은 이 사건 건물 중 일부에 대한 보수비에 해당하므로 수입금액에 산입될 수 없다고 주장한다. 그러나 이 사건 보상금이 수입금액에 해당함은 앞서 본 바와 같고, 다만 원고가 이 보상금을 보수비로 지출한 경우 해당 금액을 필요경비로 인정받을 여지가 있을 뿐이다. 원고가 이 사건 보상금을 실제 보수비로 지출하였는지 여부, 원고가 이 사건 수용 이후 이 사건 건물을 철거하고 새로운 건물을 건설하였는지 여부 등은 이 사건 보상금을 수입금액으로 산입하는 것과 특별한 관련이 없다.1) 그러므로 원고의 주장은 받아들일 수 없다.

주석1)_을 제6호증의 기재에 의하면, 서울지방국세청장은 이 사건 공익사업과 관련하여 수용 등으로 원고가 지급받은 이 사건 보상금과 같은 성격의 보상금을 지급받은 사업자에 대한 과세자료를 관할 세무서장에게 통보한 것으로 보이므로, 원고에게만 차별적으로 과세처분이 이루어졌다고 보기도 어렵다.

3. 결론

 그렇다면, 원고의 청구는 이유 없으므로 이를 기각하기로 하여 주문과 같이 판결한다.

관련 법령

소득세법 시행령 제51조 제3항 제5호 공익사업을 위한 토지 등의 취득 및 보상에 관한 법률 제75조의2 제1항 토지보상법 시행규칙 제35조 제2항 건축법 대법원 2008. 1. 31. 선고 2006두9535 판결

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