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판례 / 경정청구 등의 절차를 거치지 않고 양도소득세 수정신고 행위가 당연무효에 해당함을 전제로 부당이득반환을 구하는 원고의 주장은 이유 없음
판례 정보 서울북부지방법원 민사

경정청구 등의 절차를 거치지 않고 양도소득세 수정신고 행위가 당연무효에 해당함을 전제로 부당이득반환을 구하는 원고의 주장은 이유 없음

원고는 종전주택 양도와 관련하여 일시적 1세대 2주택 비과세 특례를 적용해 양도소득세를 예정신고·납부하였다가, 이후 세대전입 요건 미충족을 이유로 비과세를 부인하여 수정신고하고 추가 세액을 납부하였다. 원고는 경정청구나 이의신청·심사청구·심판청구 절차를 거치지 않고 추가 납부한 양도소득세의 반환을 구하였다. 법원은 신고납세 방식의 조세에서 납세자의 신고행위가 중대하고 명백한 하자로 당연무효가 되지 않는 한 납부세액 보유가 부당이득이 될 수 없다고 보았다. 이 사건 수정신고는 관계 법령에 따라 원고가 스스로 과세표준과 세액을 정한 것으로 당연무효라고 할 수 없고, 시행령 부칙의 위헌 주장도 특별한 사정이 없는 한 당연무효사유가 아니므로 원고의 청구를 기각하였다.

서울북부지방법원2024가단147974 2025.06.25 마지막 업데이트 2026.05.27

기본 정보

법원
서울북부지방법원
사건번호
서울북부지방법원2024가단147974
사건구분
가단
선고일
2025.06.25
상단 광고
상단 광고
목차 사실관계 판단 결과 핵심 쟁점 판례 포인트 자주 묻는 질문 판결 내용 관련 법령 관련 판례

사실관계

정리된 사실관계가 없습니다.

판단 결과

정리된 판단 결과가 없습니다.

핵심 쟁점

  • 신고납세 방식의 조세에서 납세자의 수정신고가 당연무효에 해당하는지 여부
  • 양도소득세 수정신고에 따른 납부세액이 부당이득반환 대상이 되는지 여부
  • 경정청구 등 조세구제절차를 거치지 않고 민사상 부당이득반환청구를 할 수 있는지 여부
  • 소득세법 시행령 부칙의 위헌 주장이 수정신고행위의 당연무효사유가 되는지 여부
  • 일시적 1세대 2주택 비과세 특례의 세대전입 요건 미충족을 이유로 한 수정신고의 효력

판례 포인트

  • 신고납세 방식에서는 납세자가 스스로 과세표준과 세액을 신고함으로써 납세의무가 구체적으로 확정된다.
  • 신고행위가 중대하고 명백한 하자로 당연무효가 아닌 이상, 그 신고에 따라 납부된 세액은 곧바로 부당이득이 되지 않는다.
  • 과세처분 또는 신고행위의 하자가 취소사유에 그치는 경우에는 적법한 불복·취소 절차를 거쳐야 부당이득반환을 주장할 수 있다.
  • 헌법재판소의 위헌결정 전 법령 위헌 주장은 특별한 사정이 없는 한 행정처분의 취소사유가 될 수 있을 뿐 당연무효사유로 보기는 어렵다.
  • 경정청구나 조세불복절차를 거치지 않고 수정신고의 당연무효만을 전제로 한 과오납금 반환청구는 인정되기 어렵다.

자주 묻는 질문

Q 양도소득세 수정신고 후 경정청구 없이 바로 부당이득반환을 청구할 수 있나요?

A 서울북부지방법원은 원고가 경정청구나 이의신청, 심사청구, 심판청구 등의 절차 없이 곧바로 과오납 양도소득세 반환을 구한 청구를 기각했습니다. 신고납세 방식의 조세에서는 납세자가 스스로 신고한 과세표준과 세액으로 납세의무가 확정되므로, 신고행위가 중대하고 명백한 하자로 당연무효가 아닌 한 납부세액 보유가 곧바로 부당이득이 된다고 보기는 어렵다고 판단했습니다.

Q 일시적 1세대 2주택 비과세를 부인해 한 양도소득세 수정신고는 당연무효인가요?

A 이 사건에서 원고는 일시적 1세대 2주택 비과세 특례를 적용해 양도소득세를 신고했다가, 세대전입 요건을 충족하지 못한 것으로 보아 수정신고하고 추가 세액을 납부했습니다. 법원은 이 수정신고가 구 소득세법과 구 소득세법 시행령에 따라 원고가 스스로 과세표준과 세액을 정한 행위라고 보아, 중대하고 명백한 하자로 인한 당연무효라고 할 수 없다고 판단했습니다.

Q 투기 목적이 없다는 사정만으로 양도소득세 중과나 비과세 배제를 무효라고 볼 수 있나요?

A 원고는 투기 목적이 없는 경우까지 양도소득세를 중과세하는 것은 1세대 2주택 비과세 특례의 입법목적에 반한다고 주장했습니다. 그러나 법원은 원고의 수정신고가 관계 법령에 따라 이루어진 이상 중대하고 명백한 하자가 있다고 볼 수 없다고 보아, 추가 납부세액을 부당이득으로 반환해야 한다는 주장을 받아들이지 않았습니다.

Q 소득세법 시행령 부칙이 위헌이라는 주장은 양도소득세 수정신고의 당연무효 사유가 되나요?

A 원고는 소득세법 시행령 부칙에서 개정규정을 소급 적용하지 않은 것이 위헌적 규정으로 무효라고 주장했습니다. 법원은 일반적으로 법령의 위헌 여부는 특별한 사정이 없는 한 행정처분 취소소송의 전제가 될 수 있을 뿐, 곧바로 당연무효 사유가 되는 것은 아니라고 보았습니다. 이에 따라 위헌 주장을 전제로 한 부당이득반환 청구도 받아들이지 않았습니다.

Q 서울북부지방법원 2024가단147974 사건에서 원고의 양도소득세 과오납금 환급청구는 왜 기각됐나요?

A 서울북부지방법원은 2025년 6월 25일 원고의 양도소득세 과오납금환급청구를 기각하고 소송비용도 원고가 부담하도록 했습니다. 법원은 원고의 수정신고가 관계 법령에 따라 스스로 과세표준과 세액을 정한 것이며, 중대하고 명백한 하자로 당연무효라고 볼 수 없다고 판단했습니다. 따라서 경정청구 등의 절차 없이 수정신고의 당연무효를 전제로 한 부당이득반환 주장은 이유 없다고 보았습니다.

판결 내용

  • 국기
경정청구 등의 절차를 거치지 않고 양도소득세 수정신고 행위가 당연무효에 해당함을 전제로 부당이득반환을 구하는 원고의 주장은 이유 없음 국승
  • 서울북부지방법원2024가단147974
  • 귀속년도 : 2024
  • 심급 : 1심
  • 등록일자 : 2025.08.06.
  • 생산일자 : 2025.06.25.
  • 진행상태 : 완료
관련 법령
국세기본법 제56조 제2항
요지 판결내용 상세내용

요지

원고의 양도소득세 수정신고 행위는 구 소득세법 제89조 제1항, 구 소득세법 시행령 제155조 제1항에 의하여 스스로 과세표준과 세액을 정하여 이루어진 것으로, 관계 법령에 따른 원고의 양도소득세 수정신고 행위가 중대하고 명백한 하자로 인하여 당연무효라고 할 수 없음

판결내용

판결 내용은 붙임과 같습니다.

상세내용

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사 건

2024가단147974 양도소득세 과오납금환급청구의 소

원 고

이○○

피 고

대한민국

판 결 선 고

2025. 6. 25.

주 문

1. 원고의 청구를 기각한다.

2. 소송비용은 원고가 부담한다.

청 구 취 지

피고는 원고에게 XXX,XXX,XXX원 및 이에 대하여 이 사건 소장 부본 송달일부터 다 갚는 날까지 연 12%의 비율로 계산한 돈을 지급하라.

이 유

1. 기초사실

 가. 원고는 20XX. X. XX. 서울 XX구 X동 XXX XXXX아파트 XXX동 XXXX호를 취득하고, 20XX. XX. XX. 서울 XX구 XX동 XXX 외 X필지 XXXXXXXXX XXX동 XXXX호(이하 ‘이 사건 종전주택’이라 한다)를 양도한 후 20XX. XX. XX. 구 소득세법 시행령(2022. 5. 31. 대통령령 제32654호로 개정되기 전의 것, 이하 같다) 제155조 제1항의 일시적 1세대 2주택 비과세 특례규정을 적용하여 이 사건 종전주택 양도에 따른 20XX년 귀속 양도소득세 X,XXX,XXX원을 예정신고하고, 20XX. XX. XX. 신고세액을 납부하였다.

 나. 원고는 20XX. X. X. 구 소득세법 시행령 제155조 제1항의 세대전입 요건을 미충족한 것으로 보아 일시적 1세대 2주택 비과세를 부인하여 20XX년 귀속 양도소득세를 수정신고하고, 20XX. XX. XX. 수정신고세액 XXX,XXX,XXX원을 납부하였다.

 다. 원고는 위와 같이 20XX년 귀속 양도소득세 수정신고 후 경정청구 등을 통한 양도소득세 환급청구 또는 이의신청, 심사청구, 심판청구 등의 절차 없이 과오납한 양도소득세의 반환을 구하는 이 사건 소를 제기하였다.

[인정근거] 다툼 없는 사실, 갑 제2, 6, 10, 11호증(가지번호 있는 것은 가지번호 포함)의 각 기재, 변론 전체의 취지

2. 원고의 주장

 원고와 같이 투기 목적이 없는 것이 명백한 경우에까지 양도소득세를 중과세하는 것은 1세대 2주택 비과세 특례규정의 입법목적에 반하고, 소득세법 시행령 부칙(2022. 5. 31.) 제3조에서 개정규정을 소급하여 적용하지 않은 것은 위헌적인 규정으로 무효에 해당하므로, 피고는 원고가 추가로 납부한 양도소득세 XXX,XXX,XXX원을 부당이득으로 원고에게 반환하여야 한다.

3. 관계 법령

별지 기재와 같다.

4. 판단

 가. 관련 법리

  신고납세 방식의 조세에 있어서는 원칙적으로 납세의무자가 스스로 과세표준과 세액을 정하여 신고하는 행위에 의하여 납세의무가 구체적으로 확정되고(과세관청은 납세의무자로부터 신고가 없는 경우에 한하여 비로소 부과처분에 의하여 이를 확정하게 되는 것이다.), 그 납부행위는 신고에 의하여 확정된 구체적 납세의무의 이행으로 하는 것이며 국가나 지방자치단체는 그와 같이 확정된 조세채권에 기하여 납부된 세액을 보유하는 것이므로, 납세의무자의 신고행위가 중대하고 명백한 하자로 인하여 당연무효로 되지 아니하는 한 그것이 바로 부당이득에 해당한다고 할 수 없고, 여기에서 신고행위의 하자가 중대하고 명백하여 당연무효에 해당하는지의 여부에 대하여는 신고행위의 근거가 되는 법규의 목적, 의미, 기능 및 하자 있는 신고행위에 대한 법적 구제수단등을 목적론적으로 고찰함과 동시에 신고행위에 이르게 된 구체적 사정을 개별적으로 파악하여 합리적으로 판단하여야 한다(대법원 2002. 11. 22. 선고 2002다46102 판결 등 참조).

  조세의 과오납이 부당이득이 되기 위하여는 납세 또는 조세의 징수가 실체법적으로나 절차법적으로 전혀 법률상의 근거가 없거나 과세처분의 하자가 중대하고 명백하여 당연무효이어야 하고, 과세처분의 하자가 단지 취소할 수 있는 정도에 불과할 때에는 과세관청이 이를 스스로 취소하거나 항고소송절차에 의하여 취소되지 않는 한 그로 인한 조세의 납부가 부당이득이 된다고 할 수 없다(대법원 1994. 11. 11. 선고 94다28000 판결 등 참조).

  위헌결정의 효력은 그 결정 이후에 당해 법률이 재판의 전제가 되었음을 이유로 법원에 제소된 일반사건에도 미치므로, 당해 법률에 근거하여 행정처분이 발하여진 후에 헌법재판소가 그 행정처분의 근거가 된 법률을 위헌으로 결정하였다면 결과적으로 행정처분은 법률의 근거가 없이 행하여진 것과 마찬가지가 되어 하자가 있는 것이 되나, 이미 취소소송의 제기기간을 경과하여 확정력이 발생한 행정처분의 경우에는 위헌결정의 소급효가 미치지 않는다고 보아야 할 것이고, 일반적으로 법률이 헌법에 위반된다는 사정은 헌법재판소의 위헌결정이 있기 전에는 객관적으로 명백한 것이라고 할 수는 없으므로 헌법재판소의 위헌결정 전에 행정처분의 근거가 되는 당해 법률이 헌법에 위반된다는 사유는 특별한 사정이 없는 한 그 행정처분의 취소소송의 전제가 될 수 있을 뿐 당연무효사유는 아니라고 봄이 상당하다(대법원 2002. 11. 8. 선고 2001두3181 판결 등 참조).

 나. 구체적인 판단

  위 법리에 비추어 보건대, 원고의 양도소득세 수정신고행위는 구 소득세법(2021.12. 8. 법률 제18578호로 개정되기 전의 것) 제89조 제1항, 구 소득세법 시행령 제155조 제1항에 의하여 스스로 과세표준과 세액을 정하여 이루어진 것으로, 관계 법령에 따른 원고의 양도소득세 수정신고행위가 중대하고 명백한 하자로 인하여 당연무효라고 할 수 없다.

  나아가 원고가 주장하는 소득세법 시행령 부칙(2022. 5. 31.) 제3조의 위헌 여부는 특별한 사정이 없는 한 행정처분의 취소소송의 전제가 될 수 있을 뿐 당연무효사유는 아니라고 할 것이므로, 경정청구 등의 절차를 거치지 않고 양도소득세 수정신고행위가 당연무효에 해당함을 전제로 부당이득반환을 구하는 원고의 주장은 이유 없다.

3. 결론

 그렇다면 원고의 이 사건 청구는 이유 없으므로 기각하기로 하여 주문과 같이 판결한다.

관련 법령

국세기본법 제56조 제2항 구 소득세법 제89조 제1항 구 소득세법 시행령 제155조 제1항 소득세법 시행령 부칙(2022. 5. 31.) 제3조 대법원 2002. 11. 22. 선고 2002다46102 판결 대법원 1994. 11. 11. 선고 94다28000 판결 대법원 2002. 11. 8. 선고 2001두3181 판결

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